本发明公开的从蟹壳中一步脱钙、脱蛋白、脱脂肪提取甲壳素的方法，将洁净的废弃蟹壳与由含9个以上碳原子的磺酸配制而成的磺酸溶液按1:5～20的固液比混合，于25～70℃反应8～24h，对蟹壳同时进行脱钙、脱蛋白质、脱脂肪，反应后水洗去除残留的磺酸，过滤、烘干即得甲壳素。本发明方法从蟹壳中一步脱钙、脱蛋白、脱脂肪提取甲壳素，直接省略了传统方法中大量强碱的使用和繁琐的制备步骤，避免中间步骤中蟹壳的多次转移以及清洗制备过程中残留的酸和碱所需消耗的大量水，有效缩短提取时间和降低人工成本，提高提取效率。本发明产生的副产物磺酸钙和蛋白质易于回收、纯化，在实现废弃蟹壳再利用的同时，达到了蟹壳提取甲壳素的清洁生产和全价利用。