本发明公开了一种综合处理利用虾蟹壳提取甲壳素的方法，利用谷氨酸对虾蟹壳脱钙，氢氧化钾脱蛋白，得到符合工业级或食品级要求的甲壳素。本发明方法在提取甲壳素的同时，将虾蟹壳中的碳酸钙先转变为可溶性的谷氨酸钙，再转变为难溶性的磷酸氢钙（可作为饲料添加剂），并实现了价格较贵的谷氨酸的回收循环利用；同时，将脱蛋白步骤中产生的碱性蛋白水解液与含有铵盐和磷酸盐的酸性滤液混合后浓缩，得到含有氨基酸态氮、磷、钾的液态肥（可作为植物生长的叶面肥），得到了多种副产物，一举多得，实现了甲壳素的清洁生产及虾蟹壳的全组分、高值化综合处理利用，不产生环境污染，反应条件适宜，解决了传统工艺中的资源浪费和环境污染问题，应用前景广阔。