研究团队利用scDeChIC-seq技术,系统描绘了小鼠早期胚胎发育过程(涵盖桑椹胚、内细胞团及滋养外胚层)中组蛋白修饰H3K4me3与染色质相关蛋白CTCF、RAD21的分布特征,揭示了不同谱系细胞在发育过程中染色质调控状态的重塑过程。此外,本研究为传统方法所观测到的早期胚胎中broad H3K4me3与ncH3K4me3结构域提供了单细胞分辨率的真实信号分布图谱,从而阐明了基于群体测序方法所揭示的该类结构域的生物学本质。
重要的是,针对结合丰度和稳定性都较低的传统转录因子,scDeChIC-seq仍能成功检测到稳定的结合信号,包括NR5A2、TFAP2C和KLF5等。与传统方法使用上千个细胞获得的数据相比,两者表现出较高的一致性,充分验证了该技术在稀缺生物样本分析中的灵敏度与稳定性(图2)。