一种适用于体域网的生理信号安全压缩方法和系统，所述系统中，体域网为发送端，医疗机构服务器为接收端。所述加密压缩方法包括：接收端将获取的生理信号经过去噪，基于信号完整特征周期划分为固定长度的短数据段，每个短数据段采用一次性的随机测量矩阵用于加密和压缩，再通过公共无线通道分批发送到接收端；接收端获取加密后数据段，利用安全通道接收的密钥重构对应的随机测量矩阵，并一次性将多个加密数据进行解密解压处理，并重构原始新生信号。该方法实现了压缩和加密同时完成，在体域网端采用短数据段降低了计算复杂度，在服务器端则对多个数据段进行一次性解密解压，实现了实时性，适用于计算资源受限的体域网健康医疗应用。